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Environnement de travail

L'équipe VisAGeS est en partie rattachée à l'IRISA qui fournit et entretien le matériel informatique. C'est aussi l'IRISA qui fournit les services réseau (web, mail, news, etc), support de stockage (NAS), grille de calcul. Cette rubrique de l'intranet IRISA explique comment bien utiliser ces ressources. L'IRISA fournit également des services disponibles sur l'intranet :
L'agenda (disponible également depuis l'internet)
Le helpdesk
La gestion des congés (gtt)
Un webmail (disponible également depuis l'internet)

Espace de stockage

Toutes les informations sont sur cette page.

Postes de travail

L'équipe VisAGeS dispose de plusieurs postes de travail installés avec différents systèmes et sous différentes configurations matérielles. Voici une liste des machines disponibles dans l'équipe.

Quelques trucs et astuces pour Linux

Où trouver les programmes installés sur les machines de l'équipe

Vistal

Vistal est installée et utilisable sur les systèmes Linux : parkinson, chiasma, sylvius et broca. Les binaires se trouvent dans /local/vistal/bin. Tous les binaires sont compilés statiquement et peuvent donc être utilisés en les copiant sur une autre machine sans avoir à mettre à jour de variables d'environnement ($LD_LIBRARY_PATH). Il faut faire cependant attention aux versions des distributions :

  • Sylvius et Broca sont en FC4 donc les binaires fonctionnent normalement sur tous les autres systèmes plus récents (FC4, FC6, Ubuntu Feisty Fawn, Debian Etch)
  • Parkinson et Chiasma sont en FC6 donc les binaires fonctionnent seulement sur les systèmes plus récents (FC6, Ubuntu Feisty, Debian Etch).

Dans le doute prenez ceux disponibles sur Sylvius ou Broca.

Cas du GISViewer : le GISViewer doit être copié avec le fichier StateMachine.xml qui se trouve au même endroit que le binaire.

Les versions des binaires sont mises à jour avec la forge chaque dimanche à minuit.

ITKSnap

De même que pour Vistal et le GISViewer, InsightSNAP est disponible sur sylvius, broca, parkinson et chiasma dans /local/visages/soft/apps/snap. Il s'agit aussi d'un binaire compilé statiquement donc il réutisable depuis n'importe quelque machine tournant sous Linux (>= FC4).

Anatomist et brainvisa

Une version d'anatomist (idem pour brainvisa) est disponible sur le compte medical. Depuis un poste de travail, ces deux applications sont disponibles dans /udd/visages/medical/soft/SHFJ. Depuis un portable, il faut se connecter sur un poste de travail Linux via la commande :

ssh -X PosteDeTravail

Délégation totale (portables)

Les machines en délégation sont destinées aux membres permanents et aux thésards de l'équipe. Ces catégories de personne sont considérées par l'IRISA comme adminitrateurs de leur(s) machine(s). Cette rubrique propose donc un guide de démarrage en fonction des trois configurations de système proposées par l'IRISA :

Impression

Rappel pour les noms des imprimantes à utiliser dans les locaux VisAGeS.

Fac de médecine

Imprimante N&B : mMrouge0 ⇒ Interface web Imprimante Couleur : cMrouge1

IRISA

Imprimante N&B : mCbleu0 ⇒ Interface web Imprimante Couleur : cCbleu1

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